在高密度的工厂化养殖模式中，尾水中85%以上的有害物质，都源于鱼虾粪便、饲料残渣、掉落鱼磷等废弃杂物。竖流式沉淀器和滚筒微滤机的分筛、排除，虽然能将尾水中肉眼可见的有害颗粒物滤出，小颗粒、肉眼看不见、溶于水的有机杂质却依然会“逍遥法外”，蛋白质分离器应运而生。

养殖生物的排泄物、残渣剩食被分解成众多高分子有机物，这些有机物会逐渐形成有毒物质，对海水鱼、珊瑚、虾、海参等海水生物的生存构成一定威胁，而蛋白质分离器就能够有效去除水中有机物，预防其在水体中分解可直接从水中吸附脱除掉胶状体、纤维素、蛋白素、残饵和粪便等有机物，可以保证养殖用水水质为鱼类养殖创造良好的生存环境。

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