简单地讲，蛋白质分离器的工作就是气泡的张力把脏东西顶出来与水分离，此时脏东西和水分离了。而由蛋分分离出的蛋白质，会呈现出类似液体形式储存在收集罐里，然后定期清理掉。

蛋白质分离器的具体处理流程为：需要处理的水体进入混合室的下部，在混合室切割导流的作用下，做UV混合水流，水体向上移动后再翻滚向下，到达出水口；进水采用TM进气切割装置进气并产生大量微气泡，随着水体进入气水混合室，在水体翻滚时水气充分混合，到达分离界面后，水向下方流动，悬浮的未溶解和溶解的蛋白微粒聚集在微气泡表面，气浮向上推动脱离出水体，进入顶部的收集管后通过泡沫排污管排出，处理后的水沿主出水口流出，调整出水球阀可以实现理想液位。这种结构设计在确保蛋白质分离效率的同时，TM进气切割装置的利用，取消了传统的射流泵，大大节约了能耗，提升的设备的稳定性及可靠性。

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